1967 yılında Erzincan-Kemah ilçesinde doğdu.

İlkokulu ve İmam Hatip Lisesini İstanbul-Üsküdar’da bitirdi. 1985 yılında Erciyes Üniversitesi İlahiyat Fakültesini kazandı. Burada 1 yıl öğrenim gördükten sonra Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi’ne geçti ve 1989 yılında buradan mezun oldu.

1998 yılında “17. ve 18. yüzyıllarda Osmanlı’da Hırsızlık Suçu ve Cezası” adlı teziyle doktor unvanını aldı.

1990 yılında göreve başladığı Üsküdar Küplüce Cami’inde 13 yıl İmam-Hatiplik görevinden sonra 2002 yılında Diyanet İşleri Başkanlığı’nda Din İşleri Yüksek Kurulu Uzmanı oldu.

2005-2010 yılları arasında Dini Yayınlar Dairesi Başkanlığında Derleme ve Yayın Şubesi Müdürlüğü görevinde bulundu.

15.02.2011’de Bilgi Yönetimi ve İletişim Daire Başkanlığına atandı.

2018-2021 yılları arasında Başkanlık Müşaviri, 2021-2022 yılları arasında da Din İşleri Yüksek Kurulu Uzmanı olarak görev yaptı.

20.02.2023 tarihinde Doçent olarak Düzce Üniversitesi İlahiyat Fakültesindeki görevine başladı. 

06.03.2018 tarihinde “Osmanlı Toplumunda Zındıklık -Patburunzâde Örneğinde Bir İnceleme-” adlı temel çalışmasıyla, Doçent oldu. 06.03.2024 tarihinde de Profesör unvanı aldı.

Prof. Dr. Ömer Menekşe’nin yayımlanmış çalışmaları arasında “Kemah Âlimleri”, “Ehl-i Beyt Sevgisi”, “Rahmet Peygamberi Hz. Muhammed”, “Eyvah Gıybet Ettik”, “Madde Bağımlılığı”, “21. Yüzyıl Türkiye’sinde Din ve Diyanet I-II, Prof. Dr. Ali Bardakoğlu, (Derleme)”, “Osmanlı Toplumunda Zındıklık -Patburunzâde Örneğinde Bir İnceleme-“, “Selçuklu İslam Hukuku (Yükseliş Devri)”, "Türkiye Selçukluları Dönemi: Konya Fıkıh Âlimleri", “İslam Hukukunda Hırsızlık Suçu ve Cezası” başlıklı kitapları, çeşitli dergilerde yayımlanmış makaleleri ve denemeleri ile II. Uluslar Arası Dini Yayınlar Kongresi’nde sunduğu “Türk Sinemasında Din ve Din Adamı İmajı” adlı bir tebliği bulunmaktadır.